Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRDM2Q13029 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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