Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMAN2Q12907 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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