Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
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