Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms