Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYP4F3Q08477 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F3Q08477 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms