Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC18A2Q05940 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms