Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms