Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CTXN3-202ENST00000395322 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 KCNMB2-AS1-204ENST00000437488 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC132008.2-201ENST00000453454 956 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC119674.1-221ENST00000641594 1213 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 KRT18P50-201ENST00000404337 1243 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNB1Q02641 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms