Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP27A1Q02318 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP27A1Q02318 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms