Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTUD4Q01804 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms