Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRAMEP78395 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms