Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP2P78314 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP2P78314 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms