Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP46P62068 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP46P62068 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP46P62068 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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