Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOAP61586 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOAP61586 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOAP61586 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms