Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DCDC1P59894 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DCDC1P59894 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCDC1P59894 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DCDC1P59894 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCDC1P59894 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCDC1P59894 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCDC1P59894 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DCDC1P59894 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DCDC1P59894 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms