Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRP55822 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRP55822 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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