Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ATRXP46100 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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