Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms