Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MLH1P40692 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms