Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZEB1P37275 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZEB1P37275 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms