Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFC1P35251 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFC1P35251 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFC1P35251 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFC1P35251 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFC1P35251 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms