Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJA4P35212 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms