Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCKBRP32239 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms