Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms