Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
YY1P25490 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
YY1P25490 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
YY1P25490 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
YY1P25490 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms