Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRGP23470 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
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