Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDCP19113 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDCP19113 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDCP19113 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms