Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCP1P17987 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCP1P17987 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCP1P17987 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms