Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREB1P16220 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB1P16220 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms