Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ITGB4P16144 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms