Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
POLBP06746 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
POLBP06746 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms