Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IFNB1P01574 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms