Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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