Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EXTL3O43909 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms