Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBXN8O00124 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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UBXN8O00124 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBXN8O00124 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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UBXN8O00124 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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UBXN8O00124 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBXN8O00124 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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