Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL33A6NCF5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHL33A6NCF5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms