Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP15Q9Y4E8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms