Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SH3BP1Q9Y3L3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BP1Q9Y3L3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms