Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP20Q9Y2K6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms