Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDC23Q9UJX2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms