Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CYTH4Q9UIA0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms