Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPASTQ9UBP0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms