Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRPC4Q9UBN4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms