Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RCC2Q9P258 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RCC2Q9P258 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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