Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLSPNQ9HAW4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLSPNQ9HAW4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms