Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COG4Q9H9E3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms