Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BHLHE41Q9C0J9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms