Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CEP44Q9C0F1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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