Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKD2Q9BZL6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms