Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms